魔法公主
宮崎駿經常以女性為主角，但這次主角是男性，雖然片名是「魔法公主」，不過實際上男主角戲份比女主角多了許多。不過若有看過漫畫風之谷，可以發現男主角阿席達卡根本可說是漫畫中娜烏西卡的男性版化身，一直追求著最終的真相與調停各方勢力，還有不可思議的魅力與力量，只是這種位格其實可算是中性的，以男性或女性來表現都無不同。在劇中男主角阿席達卡是古代被滅亡的日本原住民蝦夷族後代，該族隱居在極東之境，本身對森林就有不同於其他外移者的崇敬之心。所以讓男主角具有能理解森林的文化與血統，也正是要連接去理解女主角捨棄人類身份的立場。
女主角小桑是被人類捨棄而成為受森林眷顧的半人半獸，本身身份也是受到某些森林種族如大猩猩的質疑，但若要成為人類則是更不可能的事，除了不被人類接受外，內心中被人類拋棄的經歷早已看透人類為求生存的自私，所以會去認同森林中一體同心的立場，也造成他身份認同的矛盾。但由阿席達卡對她說出：「你好美！」這句話時，卻喚醒了她身為人的身份，而後小桑決定解救阿席達卡也是在於能有人理解她的身份認同窘境。
還有一毀譽參半的角色黑帽子大人，也令人印象深刻。她受城中百姓的愛戴，不光只有優秀的領導能力，也能讓生活艱困的人能有繼續生存下去的力量，是與自然抗爭人定勝天的力量。宮崎駿一貫強調其強勢女性的立場，由於黑帽子大人身為女性，於是城中就由女性主掌勢力。像劇中女性寬鬆不拘禮節的衣服，言行開朗自在，並與外敵武士做守城保衛戰。由於古代給人的印象，就是女性是遭受壓抑的，是苦悶的，但電影中的表現卻是相反，使人感受到那個時代另一種世外桃源之感，可說是對以男性為主導的反動。
另外還有一個人要提的，就是疙瘩和尚。他為了找尋永生的秘密，不擇手段，慫恿黑帽子等人，去殺死獸神（鹿神），他如自己最後所說的，人類就是有一種貪念，一直想要得到更好的。宮崎駿並沒有把他塑造成大壞蛋，還給他逗趣圓滑的性格，最後也沒把這個造成大混亂的罪魁禍首幹掉，也是在隱喻著人類往往就是無法放棄這個想要追求生命奧秘的欲望。